Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Afg3l1Q920A7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Afg3l1Q920A7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms