Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms