Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Synpo2Q91YE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms