Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Creb3l3Q91XE9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms