Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms