Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms