Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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