Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms