Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BbxQ8VBW5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms