Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim29Q8R2Q0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms