Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Impg1Q8R1W8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Impg1Q8R1W8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Impg1Q8R1W8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Impg1Q8R1W8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Impg1Q8R1W8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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