Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

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Length 791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms