Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms