Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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