Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms