Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OptnQ8K3K8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms