Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms