Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prkd3Q8K1Y2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd3Q8K1Y2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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