Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbc1d23Q8K0F1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tbc1d23Q8K0F1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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