Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms