Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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