Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Card11Q8CIS0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Card11Q8CIS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Card11Q8CIS0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Card11Q8CIS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Card11Q8CIS0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Card11Q8CIS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Card11Q8CIS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms