Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CopaQ8CIE6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms