Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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