Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG79

Tp53bp2, Apoptosis-stimulating of p53 protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp2Q8CG79 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp2Q8CG79 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53bp2Q8CG79 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms