Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hpf1Q8CFE2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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