Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms