Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh13Q8CEE7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh13Q8CEE7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms