Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms