Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrif1Q8CDD9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrif1Q8CDD9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Lrif1Q8CDD9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lrif1Q8CDD9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lrif1Q8CDD9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lrif1Q8CDD9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrif1Q8CDD9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms