Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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