Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms