Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms