Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yod1Q8CB27 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yod1Q8CB27 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Yod1Q8CB27 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms