Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms