Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dclre1bQ8C7W7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms