Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn17Q8BXA6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn17Q8BXA6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn17Q8BXA6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn17Q8BXA6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn17Q8BXA6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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