Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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