Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms