Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcl3Q8BVF2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms