Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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