Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gga3Q8BMI3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms