Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Tmem260Q8BMD6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem260Q8BMD6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms