Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smoc1Q8BLY1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms