Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp54Q8BL06 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp54Q8BL06 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms