Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms