Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms