Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms