Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htatsf1Q8BGC0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms