Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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